Неудачные попытки захвата Казани привели Ивана Грозного в 1551 году издать приказ об основании на Волге мощной базы собственной армии. Возведение предполагалось в том месте, где река Свияга впадает в Волгу. Новая крепость была возведена за месяц. Изначальные построения начались в окрестностях Углича, и продолжились вниз по Волге к Свияжску. Город-крепость изначально выполнял полностью свои обязанности. Спустя год после его основания Казанское ханство под натиском русских войск было отвоевано. После таких трагических событий город потерял военную значимость. Дальнейшая судьба исторического места была связана с религиозными традициями. На острове было возведено несколько христианских монастырей.